Die Inhalte der Prüfverfahren und die Indikatoren (Qualitätsmerkmale), mit denen die Behandlungsqualität der Kliniken gemessen wird, wurden auf Bundesebene bis zum 31.12.2009 durch die Bundesgeschäftsstelle Qualitätssicherung (BQS) und ihre Fachgruppen festgelegt; seit dem 1.1.2010 ist hierfür das AQUA-Institut in Göttingen zuständig.
Die von den Kliniken gelieferten Daten werden von Geschäftsstellen zur Qualitätssicherung in jedem Bundesland ausgewertet und beurteilt. Auf Landesebene ist das Qualitätsbüro Bremen für die Arbeit mit den Krankenhäusern, den Landesfachgremien und dem Lenkungsausschuss zuständig. Das Qualitätsbüro Bremen wird von der Krankenhausgesellschaft, den Krankenkassen, dem Pflegerat und der Ärztekammer getragen.
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